Isterinya Jahangir bernama Nur Jahan. Nur Jahan adalah janda seorang perwira pemberontak, Sher Afghanistan, dari Mughal. Gabenor Bengal berjaya dibunuh dan jandanya Mehr-un-Nisa, dibawa ke Agra ditempatkan di harem diraja pada tahun 1607. Jahangir menikahinya pada tahun 1611 dan memberinya nama Nur Jahan atau "Terang Dunia". Nur Jahan memiliki kecerdasan yang tinggi . Dia memiliki kekuatan fizikal yang besar dan keberanian. Dia suka memburu dengan suaminya dan pernah membunuh harimau yang mengganas.

Hilangnya Kandahar adalah kerana Putera Khurram menolak arahannya. Ketika Parsi mengepung Kandahar, Nur Jahan mengetuai pasukan. Kemudian di atas rasa takut, putera Khurram memberontak melawan ayahnya daripada melawan Parsi dan dengan demikian Kandahar terlepas kepada Parsi.